데이터셋 상세
미국
Germplasm Resources Information Network (GRIN)
,The Germplasm Resources Information Network (GRIN) is an online portal for information about agricultural genetic resources that are managed by the Agricultural Research Service of USDA, along with U.S. partnering organizations.,The content includes general information about ARS animal, microbial and plant germplasm collections, most notably the U.S. National Plant Germplasm System (NPGS). The NPGS curates more than 600,000 active accessions of living plant material at 20 genebank locations around the U.S., and makes small quantities available globally to plant breeders and other professional scientists.,GRIN also documents activities of Crop Germplasm Committees (CGC) that support the NPGS. The CGCs are comprised of public and private sector subject matter experts for a given crop (there are currently 44 CGCs) who voluntarily provide input on technical and operational matters to the NPGS.,The site includes two searchable datasets: the ARS Rhizobium collection and Plant Variety Protection Certificates. The Rhizobium collection is living bacteria that nodulate the roots of leguminous plants symbiotically to provide nitrogen fixation. Samples are available to research scientists globally upon request. The Plant Variety Protection (PVP) Certificates are issued by the Agricultural Marketing Service (AMS) of USDA to provide intellectual property protection to registered new varieties of plants that are propagated by seed or tubers. The GRIN site allows queries of PVPs by certificate number, name of the crop, variety name, or certificate holder, all using data provided by the AMS.,
데이터 정보
연관 데이터
인포보스 - 자생종 식물 유전자 데이터
공공데이터포털
● 데이터 키워드 - 유전체, 유전자, NGS, DNA ● 데이터 상품 요약 - 국내 식물 자생종과 동일한 종의 유전체 해독 원 데이터로부터 분석하여 얻어진 예측된 유전자 정보 ● 데이터 상품 정보 - 본 상품은 자생종 유전체 분석을 통해 얻어진 유전자의 유전자군 정보를 제공합니다. - 기능 도메인에 대해 기능별 유용성, 효소, 단백질, 병 저항성 유전자군 분류 가공 - 데이터 comparative analysis를 통해 유전자군별 발현 확률 및 계통 확률 계산 ● 컬럼 정보 - fasta format ● 활용 예제 - 본 데이터 상품을 활용하여 사용자는 다음과 같은 정보를 확인할 수 있습니다. 1) 신약 및 기능성 식품, 화장품 개발 관련 분야 기초자료 ● 데이터 상품 정보 - 2019년 7월 ~ 2019년 12월 [원본 데이터](https://www.bigdata-forest.kr/product/GNM100701)는 로그인 후 구매하여 다운로드 하십시오.
농촌진흥청 국립농업과학원 농업유전자원 정보 제공
공공데이터포털
농업유전자원(식물, 미생물, 누에, 곤충, 표본, 이미지) 정보를 제공하며, 자원명, 학명, 자원구분 등의 입력 값으로 조회
인포보스 - 농산물 자원 종목록
공공데이터포털
● 데이터 키워드 - 자생종, 종목록, 한약 ● 데이터 상품 정보 - 본 상품은 국내 자생하는 생물의 임산물 품명과 융합한 종목록을 제공합니다. - 종목록 임산물 정보 융합데이터 (출처: 우림인포텍) ● 컬럼(속성) 정보 - 식물분류군ID : 종목록 ID - 학명 : 생물학에서 생물의 종에 붙인 분류학적인 이름 - 임산물명 : 임산물명 ● 활용 예제 - 본 데이터 상품을 활용하여 사용자는 다음과 같은 정보를 확인할 수 있습니다. 1) 생물의 학명으로 다양한 분야의 이름을 확인하고, 데이터를 연계할 수 있습니다. ● 기간 및 범위 - 2020년 7월 ~ 2020년 12월 [원본 데이터](https://www.bigdata-forest.kr/product/GNM300301)는 로그인 후 구매하여 다운로드 하십시오.
LTAR Upper Mississippi River Basin - Morris - Swan Lake Research Farm Phenocam
공공데이터포털
,The PhenoCam network is collecting color and near infrared images year-round using cameras in fixed positions on agricultural lands including a site located on the Swan Lake Research Farm. The network effort was initiated in 2015 at this long-term, plot-scale research site. The camera at the research farm on focused a plot-scale, replicated research study that was established in 1997 to assess the long-term impacts of various tillage management options on soil organic carbon. Initially the study included eight tillage treatments: no-tillage, moldboard + disk tillage, chisel tillage, and fall and spring residue management, with or without strip-tillage and strip-tillage + sub-soiling. In 2004, the number of treatments were reduced to no-tillage, moldboard tillage, and fall and spring residue management without strip-tillage. All tillage treatments also had an early or late planting date. In 2008, the strip-tillage plots were modified to explore alternative strategies for supporting cellulosic bioenergy feedstock production, including planting of cellulosic feedstock. The modification included adding perennials grasses into an extended 6-year rotation, winter cereal rye cover crops in a corn-soybean rotation, and an alternative Sorghum-Sudan grass hybrid forage system. Detailed soil and crop properties data have been collected from this site. This site is designated to be continued as part of the LTAR "common experiment" comparing agricultural and environmental results from "business as usual" and "aspirational best practices.,
인포보스 - 자생종 식물 유전체 원 데이터
공공데이터포털
● 데이터 키워드 - 유전체, NGS, DNA ● 데이터 상품 정보 - 본 상품은 국내 식물 자생종과 동일한 종의 유전체 해독 원 데이터를 제공합니다.(인포보스 자체 생산 NGS 기초 데이터) - DNA, RNA 차세대 염기서열 분석 생산 - de novo assembly, gene prediction, functional domain 발굴 및 phylogenetic analysis를 위한 데이터 가공 ● 컬럼(속성) 정보 - fasta format ● 활용 예제 - 본 데이터 상품을 활용하여 사용자는 다음과 같은 정보를 확인할 수 있습니다. 1) 신약 및 기능성 식품, 화장품 개발 관련 분야 기초자료 ● 기간 및 범위 - 2019년 7월 ~ 2019년 12월 [원본 데이터](https://www.bigdata-forest.kr/product/GNM100401)는 로그인 후 구매하여 다운로드 하십시오.
LTAR Upper Mississippi River Basin - St. Paul - Aspirational Cropping System Phenocam
공공데이터포털
,A stationary camera used to track vegetation phenology overlooking a row crop field that is in an aspirational cropping system (corn/soybean rotation with a living much - Kura Clover). This site is located at the Rosemount Research and Outreach Center in Rosemount, Minnesota. Images are taken every 30 minutes. A link to the Phenocam's network FAQ: https://phenocam.sr.unh.edu/webcam/faq,
LTAR Upper Mississippi River Basin - St. Paul - Restored Prairie Phenocam
공공데이터포털
,A stationary camera used to track vegetation phenology overlooking a restored native prairie. This site is located at the Rosemount Research and Outreach Center in Rosemount, Minnesota. Images are taken every 30 minutes. A link to the Phenocam's network FAQ: https://phenocam.sr.unh.edu/webcam/faq,
MaizeGDB
공공데이터포털
,MaizeGDB is a community-oriented, long-term, federally funded informatics service to researchers focused on the crop plant and model organism Zea mays. Genomic, genetic, sequence, germplasm, gene product, metabolic pathways, functional characterization, literature reference, diversity, and expression are among the datatypes stored at MaizeGDB. At the project's website are custom interfaces enabling researchers to browse data and to seek out specific information matching explicit search criteria. First released in 1991 with the name MaizeDB, the Maize Genetics and Genomics Database, now MaizeGDB (since 2003), is funded, developed, and hosted by the USDA-ARS located at Ames, Iowa.,,