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Phytophthora Database
,NOTE: This resource, previously available at www.phytophthoradb.org, is no longer publicly accessible.,This database aims to include Phytophthora collections throughout the world in order to create a global atlas of the diversity and distribution of Phytophthora species.,Phytophthora, an oomycete plant pathogen, is more closely related to brown algae and diatoms than true fungi and has been placed in a separate kingdom, the Stramenopiles (Gunderson et al., 1987; Förster et al., 1990; Leipe et al., 1994). Due to their high virulence and ability to spread rapidly throughout the world, Phytophthora is one of the most important groups of plant pathogens. The destructive potential of Phytophthora diseases is well illustrated by late blight (P. infestans), which was responsible for the Irish potato famine and has again become globally problematic due to the introduction of new, fungicide-resistant lineages (Fry and Goodwin, 1997). Sudden oak death in the US (Rizzo et al., 2002) and diseases on ornamental plants in Europe (Werres et al., 2001), caused by P. ramorum, are examples of the threat to forest ecosystems and the nursery industry. Toward the goal of enhancing our ability to detect, diagnose, monitor, and manage Phytophthora diseases, we have been systematically cataloging genotypic and phenotypic data of Phytophthora spp. in a web-based database that can be easily accessed and utilized by the global community of plant health professionals. Although we are currently focusing on the genotypic characterization of the isolates archived in the World Phytophthora Collection (WPC; Phytophthora.ucr.edu) at UC-Riverside and in the Pennsylvania Department of Agriculture (PDA), we plan to include Phytophthora collections throughout the world in order to create a global atlas of the diversity and distribution of Phytophthora species. This project has been mainly supported by the NRI-Plant Biosecurity program (2005-35605-15393 and 2008-55605-18773) and currently involves the following principal investigators, including Seogchan Kang, David Geiser, and Scott Isard (Penn State), Mike Coffey (UC-Riverside), Joe Russo (ZedX, Inc.), Kelly Ivors (NC State), Frank Martin and Nik Grunwald (USDA-ARS). Grants from the Pennsylvania Department of Agriculture (ME442316 and ME 445580) and a cooperative agreement with USDA-ARS (59-1920-3-304) have also been used to support parts of this project.,Partially supported by Grant from the USDA-AFRI Plant Biosecurity program supported the establishment and improvement of the PD (2005-35605-15393 and 2008-55605-18773).,
데이터 정보
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인포보스 - 한약 자원 종목록
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● 데이터 키워드 - 자생종, 종목록, 한약 ● 데이터 상품 정보 - 본 상품은 국내 자생하는 생물의 한의학 정보와 융합한 종목록을 제공합니다. - 종목록 한의학 정보 융합데이터 (출처: 한의학연구소) ● 컬럼(속성) 정보 - 식물분류군ID : 종목록 ID - 학명 : 생물학에서 생물의 종에 붙인 분류학적인 이름 - 약재라틴명 : 약재라틴명 - 약재영문명 : 약재영문명 - 약재한글명 : 약재한글명 - 약재한자명 : 약재한자명 - 약재이명 : 약재 이명 정보 - 약재약용부위 : 약재약용부위 ● 활용 예제 - 본 데이터 상품을 활용하여 사용자는 다음과 같은 정보를 확인할 수 있습니다. 1) 생물의 학명으로 다양한 분야의 이름을 확인하고, 데이터를 연계할 수 있습니다. ● 기간 및 범위 - 2020년 7월 ~ 2020년 12월 [원본 데이터](https://www.bigdata-forest.kr/product/GNM300201)는 로그인 후 구매하여 다운로드 하십시오.
산림청 백두대간 식물바이오정보
공공데이터포털
백두대간 지역의 희귀식물 및 멸종위기, 특산식물과 귀화식물에 대한 데이터로, 식물명 및 학명과 분류정보 등을 제공합니다.
Dr. Duke's Phytochemical and Ethnobotanical Databases
공공데이터포털
,Of interest to pharmaceutical, nutritional, and biomedical researchers, as well as individuals and companies involved with alternative therapies and and herbal products, this database is one of the world's leading repositories of ethnobotanical data, evolving out of the extensive compilations by the former Chief of USDA's Economic Botany Laboratory in the Agricultural Research Service in Beltsville, Maryland, in particular his popular Handbook of phytochemical constituents of GRAS herbs and other economic plants (CRC Press, Boca Raton, FL, 1992). In addition to Duke's own publications, the database documents phytochemical information and quantitative data collected over many years through research results presented at meetings and symposia, and findings from the published scientific literature.,The current Phytochemical and Ethnobotanical databases facilitate plant, chemical, bioactivity, and ethnobotany searches. A large number of plants and their chemical profiles are covered, and data are structured to support browsing and searching in several user-focused ways. For example, users can,References to the supporting scientific publications are provided for each specific result.,,
Fletcherview Tropical Rangelands Soil Environmental DNA (eDNA) Dataset
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This dataset contains soil microbial and genomic analysis files of 9 soil samples from each of three plots at Fletcherview, Northern Queensland (NQ) processed by the Australian Genome Research Facility Ltd (AGRF) . The files are available as compressed FastQ formatted sequence files. For the nine Far North Queensland (FNQ) new plots (3 plots in Fletcherview and six plots at Wambiana), soil sampling additional to that done as component of plot installation by TERN have been undertaken. This is aligned with potential future exploratory work on soil eDNA proposed for WA. The protocol is a modified version of the BASE sampling protocol, combined with soil sampling as per White et al. (2012). DNA extracted from the soil samples and Metagenomics 10Gbp (giga base pairs) bundle as per AGRF protocol.
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● 데이터 키워드 - 유전체, NGS, DNA ● 데이터 상품 정보 - 본 상품은 국내 식물 자생종과 동일한 종의 유전체 해독 원 데이터를 제공합니다.(인포보스 자체 생산 NGS 기초 데이터) - DNA, RNA 차세대 염기서열 분석 생산 - de novo assembly, gene prediction, functional domain 발굴 및 phylogenetic analysis를 위한 데이터 가공 ● 컬럼(속성) 정보 - fasta format ● 활용 예제 - 본 데이터 상품을 활용하여 사용자는 다음과 같은 정보를 확인할 수 있습니다. 1) 신약 및 기능성 식품, 화장품 개발 관련 분야 기초자료 ● 기간 및 범위 - 2019년 7월 ~ 2019년 12월 [원본 데이터](https://www.bigdata-forest.kr/product/GNM100401)는 로그인 후 구매하여 다운로드 하십시오.
인포보스 - 국내 자생식물종목록
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● 데이터 키워드 - 종목록, 종, 분류군 ● 데이터 상품 정보 - 본 상품은 국내 자생하는 식물의 종목록을 제공합니다. - 공공데이터 종목록 데이터의 융합 데이터 - 출처 : 국립수목원(국가표준종목록), 국립생물자원관(국가생물종목록) ● 컬럼(속성) 정보 - 분류군ID - 학명 : 생물학에서 생물의 종에 붙인 분류학적인 이름 - 국명 : 한국명 - 분류계급 : 생물분류의 계층적체계 - 과명 : 생물분류의 계층적체계 중 과의 명 - 이명여부 : 이명 여부 - 정명ID : 이명 여부가 Y 인 경우 정명의 분류군ID - 정명 학명 : 정명의 분류학적 이름 - 정명 국명 : 정명의 한국명 - 명명자 : 학명의 명명자 - 명명년도 : 학명의 명명년도 - 최초명명자 : 학명의 최초명명자 - 최초명명년도 : 학명의 최초명명년도 - 설명 : 분류군의 설명 ● 활용 예제 - 본 데이터 상품을 활용하여 사용자는 다음과 같은 정보를 확인할 수 있습니다. 1) 생물의 학명을 바탕으로 유용성, 위치, 사진, 유전체 데이터 등 데이터 파악하는 것이 가능 ● 기간 및 범위 - 2019년 7월 ~ 2019년 12월 [원본 데이터](https://www.bigdata-forest.kr/product/GNM000101)는 로그인 후 구매하여 다운로드 하십시오.
NSW BioNet Flora Survey Plots – PCT Reference Sites
공공데이터포털
This is a dataset of the NSW BioNet Flora Survey Data Collection that is maintained via the Flora Survey Module of the NSW BioNet Atlas application. This collection is a central, authoritative database for systematic vegetation survey data in NSW. This dataset includes full floristic survey sites that have been allocated to PCTs through the quantitative classification method outlined in A revised classification of plant communities of eastern New South Wales (DPE 2022). https://environment.nsw.gov.au/research-and-publications/publications-search/a-revised-classification-of-plant-communities-of-eastern-new-south-wales. As such these sites are reference sites for quantitative PCTs. Access The full datasets (sites and species) may be accessed via the BioNetAtlas application http://www.BioNet.nsw.gov.au/. Site-level data (without species) is available in a machine readable form via the BioNet OData Web Service https://data.bionet.nsw.gov.au/. That OData data service is delivered to SEED where it is rendered as a map layer (i.e. Web Map Service). You may also query and extract simplified data from SEED Map View – this video explains How to access BioNet systematic flora survey plot data using the SEED portal. https://vimeo.com/455328331. Data in BioNet is made available in accordance with DPE's Sensitive Species Data Policy https://www.environment.nsw.gov.au/topics/animals-and-plants/wildlife-management/wildlife-policies-and-guidelines/sensitive-species-data. For species categorised as "sensitive", location information may be withheld depending on the species' status under the policy, and on the access rights of the user. Records in BioNet are not guaranteed to be free from error or omission.