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To assess the variability of low-abundance oligonucleotide detection across sample matrices, we spiked DNA reference standards (meta sequins) into replicate wastewater DNA extracts at logarithmically decreasing mass-to-mass percentages (m/m%) and deeply sequenced them on the Illumina platform. This dataset summarizes the experimental conditions and results of the detection frequencies of those oligonucleotides as well as detailed descriptions of the DNA reference standards used. This dataset is associated with the following publication: Davis, B., P. Vikesland, and A. Pruden. Evaluating Quantitative Metagenomics for Environmental Monitoring of Antibiotic Resistance and Establishing Detection Limits. ENVIRONMENTAL SCIENCE & TECHNOLOGY. American Chemical Society, Washington, DC, USA, 59(12): 6192-6202, (2025).

The BioSample database contains descriptions of biological source materials used in experimental assays.

As monoclonal antibodies have become a vital resource in medicine, knowledge of their complex molecular structures has increased in importance. Thousands of Fab and Fc fragments are described in the Protein Data Bank. Whole antibodies have been imaged by EM methods and in a few cases, crystallized. The central hinge lacks a unique stable conformation and its dynamic properties are important to antibody function. Monte Carlo and molecular dynamics simulations and small-angle scattering methods have been used to analyze the wide range of configurations that are accessible to antibodies in solution. In order to support the development of antibody-based medicines, the National Institute of Standards and Technology (NIST) has released an extensively characterized IgG1 mAb, called Reference Material 8671 or NISTmAb1. To facilitate modeling of whole antibodies we now report the construction of an all-atom 3-D model of RM 8671. Atomic model structure of the intact monoclonal antibody Reference Material 8671 (NISTmAb), including PDBv3 formatted file containing coordinates for each atom in x, y, z format and the FASTA formatted file containing the primary sequence.

,Wykaz i analiza wyników sekwencjonowania konstruktów panelu ligaz E3 (Cullin type) przeznaczonych do ekspresji białek rekombinowanych w systemie opartym o bakulowirusy.,

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