Transformative Research for Large Genome Physical Maps
공공데이터포털
,The main goal of the project is to construct and utilize high-resolution genome-wide RH-based physical maps of the wheat D-genome chromosomes to facilitate the construction of sequence-ready physical maps. This research provides an unprecedented view into the evolution of cereal genomes. Importantly, the methodology is being developed to be applied to other large and complex genomes such as polyploid wheat.,,
Germplasm Resources Information Network (GRIN)
공공데이터포털
,The Germplasm Resources Information Network (GRIN) is an online portal for information about agricultural genetic resources that are managed by the Agricultural Research Service of USDA, along with U.S. partnering organizations.,The content includes general information about ARS animal, microbial and plant germplasm collections, most notably the U.S. National Plant Germplasm System (NPGS). The NPGS curates more than 600,000 active accessions of living plant material at 20 genebank locations around the U.S., and makes small quantities available globally to plant breeders and other professional scientists.,GRIN also documents activities of Crop Germplasm Committees (CGC) that support the NPGS. The CGCs are comprised of public and private sector subject matter experts for a given crop (there are currently 44 CGCs) who voluntarily provide input on technical and operational matters to the NPGS.,The site includes two searchable datasets: the ARS Rhizobium collection and Plant Variety Protection Certificates. The Rhizobium collection is living bacteria that nodulate the roots of leguminous plants symbiotically to provide nitrogen fixation. Samples are available to research scientists globally upon request. The Plant Variety Protection (PVP) Certificates are issued by the Agricultural Marketing Service (AMS) of USDA to provide intellectual property protection to registered new varieties of plants that are propagated by seed or tubers. The GRIN site allows queries of PVPs by certificate number, name of the crop, variety name, or certificate holder, all using data provided by the AMS.,
인포보스 - 자생종 식물 유전자 데이터
공공데이터포털
● 데이터 키워드 - 유전체, 유전자, NGS, DNA ● 데이터 상품 요약 - 국내 식물 자생종과 동일한 종의 유전체 해독 원 데이터로부터 분석하여 얻어진 예측된 유전자 정보 ● 데이터 상품 정보 - 본 상품은 자생종 유전체 분석을 통해 얻어진 유전자의 유전자군 정보를 제공합니다. - 기능 도메인에 대해 기능별 유용성, 효소, 단백질, 병 저항성 유전자군 분류 가공 - 데이터 comparative analysis를 통해 유전자군별 발현 확률 및 계통 확률 계산 ● 컬럼 정보 - fasta format ● 활용 예제 - 본 데이터 상품을 활용하여 사용자는 다음과 같은 정보를 확인할 수 있습니다. 1) 신약 및 기능성 식품, 화장품 개발 관련 분야 기초자료 ● 데이터 상품 정보 - 2019년 7월 ~ 2019년 12월 [원본 데이터](https://www.bigdata-forest.kr/product/GNM100701)는 로그인 후 구매하여 다운로드 하십시오.
농촌진흥청 국립농업과학원 농업유전자원 정보 제공
공공데이터포털
농업유전자원(식물, 미생물, 누에, 곤충, 표본, 이미지) 정보를 제공하며, 자원명, 학명, 자원구분 등의 입력 값으로 조회
인포보스 - 자생종 식물 유전체 원 데이터
공공데이터포털
● 데이터 키워드 - 유전체, NGS, DNA ● 데이터 상품 정보 - 본 상품은 국내 식물 자생종과 동일한 종의 유전체 해독 원 데이터를 제공합니다.(인포보스 자체 생산 NGS 기초 데이터) - DNA, RNA 차세대 염기서열 분석 생산 - de novo assembly, gene prediction, functional domain 발굴 및 phylogenetic analysis를 위한 데이터 가공 ● 컬럼(속성) 정보 - fasta format ● 활용 예제 - 본 데이터 상품을 활용하여 사용자는 다음과 같은 정보를 확인할 수 있습니다. 1) 신약 및 기능성 식품, 화장품 개발 관련 분야 기초자료 ● 기간 및 범위 - 2019년 7월 ~ 2019년 12월 [원본 데이터](https://www.bigdata-forest.kr/product/GNM100401)는 로그인 후 구매하여 다운로드 하십시오.